Новый подход к диагностике рака: ищите грибницу

Два десятка лет учёные составляли карту микробов в организме человека, сопоставляя их ДНК в мазках изо рта, соскобах кожи и фекалиях. Тысячи видов живут в здоровом человеке, не доставляя хлопот. Многие органы, которые когда-то считались стерильными, оказались богаты на микрофлору.

В 2020 году сразу несколько групп исследователей выяснили, что некоторые виды опухолей содержат миллионы специфических бактерий. А два исследования, опубликованные в журнале Cell в сентябре, доказали ещё и наличие грибков. Одна клетка грибка приходится на каждые 1000−10 000 раковых.

Микробы и грибки могут способствовать росту опухоли. Например, в 2017 году биолог и онколог Равид Штраусман из Научного института Вейцмана в Реховоте, Израиль, ломал голову над тем, как некоторым опухолям поджелудочной железы удается противостоять химиотерапевтическим препаратам. Оказалось, что внутри них живет вид бактерий, способных блокировать лекарство.

Открытие микробиома рака поджелудочной железы побудило доктора Штраусмана и его коллег провести крупное исследование бактерий в более чем 1000 прооперированных опухолях. В 2020 году они открыли бактерии, скрывающихся в семи типах рака.

Одновременно группа исследователей из Калифорнийского университета в Сан-Диего опубликовала свое собственное исследование образцов из «Атласа генома рака» (огромной базы ДНК, собранной у пациентов различного онкологического профиля еще в начале 2000-х годов). Ученые просеяли шесть триллионов генетических фрагментов в поисках фрагментов бактериальной ДНК. Поиски заняли годы, зато нашли, что искали. Выяснилось, что небольшой процент фрагментов ДНК при 32 типах рака принадлежит бактериям, а не людям.

Грибок как главный признак рака

Команды из Сан-Диего и Вейцмана объединили усилия, чтобы найти ДНК грибков в «Атласе генома рака» и коллекции опухолей доктора Штраусмана. Работая с коллегами в США, они изучили опухоли 17.000 больных раком. Они обнаружила ДНК грибковых клеток в опухолях 35 различных видов рака.

Параллельно группа учёных под руководством Илияна Илиева из Колледжа Уэилл Медикал в Нью-Йорке, США, изучала опухоли ЖКТ, легких и молочных желез и обнаружила в них специфические грибки Candida, Blastomyces и Malassezia.

До сих пор было очень мало исследований грибков в опухолях, и учёные предполагали, что это редкое явление. Доктор Илана Ливиатан из Научного института Вейцмана поведала газете The Times of Israel, что учёные серьёзно заблуждались:

Мы удивлены тому, что чаще встречаются опухоли с грибками, чем без них.

Культура грибов вида Candida tropicalis, выделенная в лаборатории Илияна Илиева из аденокарциномы

Оба новых исследования обнаружили грибы, которые, по всей видимости, связаны с худшим прогнозом. Доктор Илиев и его коллеги обнаружили, что люди чаще умирают от рака желудка, если в опухоли присутствует грибок Candida tropicalis.

«Жидкая биопсия»

При каждом типе рака микробиом опухоли свой, так что ученые с 2020 года надеялись разработать способ ранней диагностики рака по «профилю» ДНК микробов в крови. Отличить фрагменты ДНК, высвобождаемые опухолевыми клетками в кровоток, можно по наличию в них специфических мутаций. Даже придумали специальный термин «жидкая биопсия».

Теперь же учёные из Калифорнийского университета, обнаружив, что на самом деле чаще обнаруживаются опухоли с грибками, чем без них, основали компанию Micronoma. По ДНК грибов в крови они смогут не только выявить рак, но точно определить его очаги. Команда из Вейцмана тоже не сидит на месте и создала «атлас грибов», характеризующих все 35 типов опухолей. Атлас можно использовать для создания новых методов скрининга.

Статья носит справочный характер и не должна рассматриваться в качестве альтернативы врачебной консультации. Запись на приём к онкологу и др. специалистам медцентра ТРАДИЦИИ:
+7 (812) 323-07-49 и +7 (921) 932-14-79